Si ya no te resistes por probar la interfaz de Gimp integrada en una sola ventana, puedes probar con instalar la versión en desarrollo. Aunque la versión 2.8 será lanzada en Diciembre, ya se pueden ir probando algunas de las nuevas funcionalidades.

Gracias a ubuntizandoelplaneta.com por elaborar ésta guía de instalación que es compatible con varias versiones de ubuntu, jaunty, Karmic y Lucid. Los pasos serían los siguientes:

Agregar el repositorio de desarrollo y reinstalar gimp normalmente.

$sudo add-apt-repository ppa:matthaeus123/mrw-gimp-svn

$sudo apt-get update && sudo apt-get install gimp
Nota: Es posible que tengamos algún problema al iniciar Gimp por primera vez. La solución pasa por instalar libgegl:

sudo apt-get install libgegl-0.0-0